第三版的GNU通用公共许可证的一个目标就是更加兼容其它的开源许可证。然而，这里有一些原因，使得这个目标在面对Apache License 2的时候无法达到。

　　正如Perl基金会的主席Allison Randal所说，他最近在O’Reilly Radar的一篇文章，《最新GPLv3 原理文档草案》一文中说，“我们很遗憾GPLv3不能与Apache Version 2.0的许可证达到兼容，尽管之前我们曾经对此作过承诺。”

　　在2006 年1月份进行的一次eWEEK 采访的时候，自由软件基金会的主席和GPL的首席作者Richard M. Stallman说：“我记起来了，Apache许可证与GPL Version 2的不兼容，原因在于商标和专利条款，我相信我们现在已经解决这两个问题。”

　　然而，就在那次采访后不久，Randal说自由软件基金会错误的认为 Apache License 2 与GPLv3不兼容。在GPLv3基本原理草案中，作者解释说，“在Apache许可证的第9部分中规定，在某些情况下，下游的批发商们必须要同意对上游许可证颁发者进行赔偿。”

　　这段令人不愉快的Apache License 2的内容为：

　　“当再次分发本产品或者使用本产品衍生的产品的时候，你可以选择提供，并且为以下内容收取费用，接受支持，授权，赔偿，或者其它应承担的责任和/或与本许可证一致的权利。然而，在接受如下义务的时候，你必须对你自己的行为负责，承担你独立的责任，而不是其它分发者得行为，只有当你同意赔偿、辩护，以及让每个分发商都无损于任何的未发生的责任，或者再次宣布，这样分发者根据你的同意来接受担保和额外的责任。”

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